光緒三年，左宗棠於伊犁增築砲台，多駐勁旅。劉錦棠就關外營勇之精壯者，編為制兵，改行餉為坐糧，參用屯田之法，以足軍實。張曜更定新疆營制三事：一、增騎兵，佐步兵之不逮；一、重火器，減養兵之費，為購器之資；一、設遊擊之師，駐南北路之間，預防俄患。六年，恭鏜因烏魯木齊之鞏寧城，接壤精河，旁達烏城間道，而舊城已圮，乃於迪化城外高原，別建新城，以駐防兵，而資控扼。十二年，劉錦棠以巴裡坤滿營歸併古城，伊犁共駐馬步防軍二十八營，酌裁新募之勇，編留精壯，為馬隊九旗，步隊十三旗，自伊犁至大河沿及精河以東，分路駐防。十四年，額爾慶額因塔爾巴哈台駐防漢隊，久役思歸，就甘肅額兵，及察哈爾部內，選二千六百人調防。十五年，復於塔城增募防兵，凡步隊三營，馬隊四旗，弁勇二千人。十六年，以伊犁滿洲營，經兵亂後，額數久虛，酌量挑補，定為二千人，再挑留錫伯、新滿洲千人，以備不足。伊犁漢隊改立標營，凡步隊一營，馬隊二營，格林砲隊一哨。惠遠城北關設砲隊一哨，定遠城設馬隊三旗。十七年，楊昌濬因塔城境內，漢、蒙、回、哈雜居，東接烏梁海，西接伊犁，地既險要，路復分歧，共增將弁三十一員，步隊三旗，馬隊四旗，以備巡防彈壓。十九年，以總兵官駐防綏定，統漢隊三千人，策應四境，若廣仁城、果子溝、三台、瞻德城、三道河、霍爾果斯、拱宸城、寧遠城，以馬步砲隊分防。三十一年，潘效蘇因新疆兵費過重，改練土著，遣散客軍。回纏民性各殊，以二三成攙入漢軍訓練，漢軍則各營旗皆減為哨，節餉防邊，始能兼顧。
宣統二年，劄拉豐阿因塔爾巴哈台屏蔽西北，以原有馬步砲隊，及左右旗蒙、滿隊，悉改新式操法。時中朝方議減餉裁兵，未遑遠略。俄羅斯正經營東陲，遂暫安無事雲。
西藏初設駐藏大臣，而番眾仍統屬於喇嘛。當崇德七年，達賴、班禪與厄魯特同時入貢。順治、康熙間，朝請不絶。康熙之季，准噶爾侵藏，由西寧進兵平之。
雍正五年，弭噶隆之爭，以頗羅鼐有定亂功，進封郡王。十年，留雲南兵於察木多，以防番眾。

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乾隆十五年，除頗羅鼐王爵，始設駐藏大臣，與達賴、班禪參互制之。其西南之廓爾喀，時窺藏境，中朝以兵力佐之，收復巴勒布所侵佔藏地，增設塘汛守兵十三處，以寨落之多寡為衡，前藏增唐古特兵八百人，後藏增四百人。五十四年，始於前後藏各設番兵千人。其通內地之定日、江孜二處要隘，各設番兵五百人，就近選補。設戴琫三人，以二人駐後藏，一人駐定日。增江孜戴琫一人。前藏番兵隷駐防遊擊，後藏番兵隷駐防都司。令四川督臣以頭等將備為駐藏之選，統以大臣。其駐藏之兵，令駐藏大臣親為校閲。嗣因定日、江孜為各部落來藏必經之路，各增防汛，設守備等官。打箭爐之外，擇地設遊擊等官。五十八年，和琳等會勘後藏邊界及鄂博情形，江孜番、漢兵已敷防守，惟定日地方遼闊，為聶拉木、宗喀、絨轄三處總匯之區，其捷徑如轄爾多、古利噶等處，均為要隘，增設番兵，統以戴琫，修寨落以備棲止，立鄂博以守界畫。
道光二年，懲治聶拉木、絨轄各營官私釋喇嘛之罪，別遣番兵補營兵之額。二十一年，令番兵習弓矢者，改習鳥槍。二十二年，令後藏大臣督率將弁教練堆葛爾本挖金番民武技。
鹹豐五年，以廓爾喀不靖，駐防兵單，令喇嘛等聯絡防範，調前藏僧俗土兵二千人赴策墊地方防範。

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同治四年，駐藏大臣滿慶等，調派土兵及統兵番員防備披楞。八年，因披楞侵佔哲孟雄，與唐古特相持，令恩麟等整頓後藏番、漢營伍。十一年，命德泰赴藏，校閲江孜、定日後藏三汛防營，以固哲孟雄及聶拉木門戶。
光緒二十四年，駐藏大臣文海因後藏定日地方營伍及靖西設防，駐藏大臣久未巡視，乃率兵親往各處校閲。光緒季年，駐藏大臣聯豫仿內地制，設武備學堂，擇營弁衛隊及達木三十九族中之優秀者，習速成科，俟畢業後，先練一營，以開風氣。
宣統二年，聯豫因工布平定，以馬步砲隊工程隊分地駐守。旋疏請裁去幫辦大臣，設左右參贊，分駐前後藏。三年，波密野番滋事，即以工布之兵剿辦，並以步隊擇地駐防，為各營後援。
至川軍入藏之舉，始於雍正初年，准噶爾窺邊，詔以川、陝兵二千人駐防，設正副大臣，分駐前後藏。其時雲南省軍隊亦分途入藏。事定，仍撤歸原省。歷朝鎮撫藏地，多用漢軍、番卒。至光緒三十一年，四川督臣錫良奏調川軍出打箭爐，並招募土勇為嚮導，以剿竄回。是年八月，巴塘喇嘛戕害大臣，全藏震動。四川提督馬維祺、建昌道趙爾豐合兵進克巴塘、裡塘，勘平邊亂。三十二年，裡塘逆番桑披復率眾倡亂，錫良命趙爾豐等以川軍討平之。其時番僧與北部回民日就衰弱，全藏邊境，為英吉利、俄羅斯遠勢所包，藏事遂不可問雲。
苗疆當貴州、湖南之境，叛服靡常，歷朝皆剿撫兼施。康熙三十八年，以鎮筸居苗疆衝要，改沅州鎮為鎮筸鎮，設總兵以下各官，增額兵千人，合原有之兵凡二千一百人，以防紅苗。雍正九年，復增兵二千人。是年，鄂爾泰因都江與清水江形勢劃分，增設清江鎮標，以新設之丹江、台拱等營，及原有之銅仁、鎮遠等營，鹹隷清江鎮。而以都勻、黎平，並上江、下江各協、營，隷於古州鎮總兵。乾隆元年，楊名時鋭意治苗，以貴州省苗眾分生熟二苗，生苗在南，熟苗在北，乃屯駐重兵於內地，而擇鄰苗之要道，增修壁壘，使民有所歸，兵有可守，遇苗眾出巢滋事，則互相援剿，戰勝勿事窮追，兼撫熟苗，俾漸知向化。五年，那蘇圖因永順所屬，緊接苗疆，且與湖北省之容美土司、四川省之酉陽土司連界，乃以永順協標兵改隷鎮筸鎮總兵，聯絡楚南聲勢，合力防苗。
嘉慶初年，戡定苗疆以後，於鳳凰、乾州、永綏、古丈坪、保靖各縣，沿邊次第建修屯堡碉台，築邊牆以嚴界畫，築土堡以資守禦，築哨台以憑瞭望，碉卡則戰守鹹資，砲台則堵截尤利。設練勇千餘人，屯丁七千人，墾闢屯防田十三萬一千餘畝，悉以屯兵耕種。其地皆附近碉堡，以便駐守，且節餉糈。歷嘉、道兩朝，沿邊寧謐。
鹹豐軍興以後，苗眾乘機肆擾。至同治年，席寶田等大舉平苗，雖間有剽掠之事，以防勇隨時剿撫。光緒十二年，譚鈞培因苗民馴擾無常，乃仿傅鼐防苗之法，增修石碉土堡，由附郭而漸及山林險阻之處，互為守望，以備苗民出入，於舊日之苗疆營制，無所變更也。
沿邊墩台、卡倫、鄂博、碉堡，清初於各省邊境扼要處，設立墩台營房，有警則守兵舉煙為號。寇至百人者，掛一席，鳴一砲；至三百人者，掛二席，鳴二砲；至五百人者，掛三席，鳴三砲；至千人者，掛五席，鳴五砲；至萬人者，掛七席，連砲傳遞。康熙七年，諭各省將領，凡水陸孔道之旁，均設墩台營房，駐宿兵丁，傳報緊急軍機，稽察匪類，護衛行人。乾隆三年，兵部議定汛兵缺少處，按地方★僻情形，酌量撥補器械，務令整備，隨時察驗。有離汛誤防者革責，官吏嚴懲之。
其軍台之制，始於順治四年，自張家口迤西，黃河迤東，設台三百四十四座，台軍七百三十二名。自張家口迄山海關迤西，設台四百十七座，台車一千二百五十一名。

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