九年，濬白茆河道，改建近海石閘。江蘇紳民請濬復淮水故道，命兩江總督、江蘇巡撫、漕運總督會籌。覆疏言：「輓淮歸故，必先大濬淤黃河，以暢其入海之路，繼開清口，以導其入黃，繼堵成子河、張福口、高良澗三河，以杜旁泄。應分別緩急興工，期以數年有效。」下部議，從之。是年內閣侍讀學士鍾佩賢亦以疏濬海港為請。於是浙撫楊昌濬言：「漊港年久淤塞，查明最要次要各工，分別估修，擬趁冬隙時，先將寺橋等九港及諸、沈二漊趕辦，其餘各工及碧浪湖工程，次第籌畫，應與吳江長橋及太湖出水各口同時修濬。」得旨允行。
十年，修龍洞舊渠，並開新渠以引涇水。江蘇巡撫張之萬請設水利局，興修三吳水利。於是重修元和、吳縣、吳江、震澤橋竇各工。最大者為吳淞江下遊至新閘百四十丈，別以機器船疏之。凡太倉七浦河，昭文徐六涇河，常熟福山港河、常州河，武進孟瀆、超瓢港，江陰黃田港、河道塘閘、徒陽河、丹徒口支河，丹陽小城河，鎮江京口河，均以次分年疏導，幾及十年，始克竣事。先是侯家林決口，河督喬松年以為時較晚，請來年冬舉辦。至是，巡撫丁寶楨言，此處決口不堵，必致浸淹曹、兗、濟十餘州縣，若再向東南奔注，則清津、裡下河一帶更形吃重，請親往督工堵築。詔獎勉之。
十二年，以直隷河患頻仍，命總督李鴻章仿雍正間成法，籌修畿輔水利。旋議定直隷諸河，皆以澱池為宣蓄。西澱數百里河道，為民生一大關鍵，先堵趙村決口，築磁河、瀦龍河南堤，以禦外水，挑濬盧僧、中亭兩河，分減大清河水勢，以免倒灌。並疏通趙王河道，將苟各莊以上巨堤及下口鷹嘴壩各建閘座。是年秋，直隷運河堤決，內閣學士宋晉請擇修各河渠，以工代賑，從之。十三年，挑濬天津陳家溝至塌河澱邊減河三千七百餘丈，又自塌河澱循金鐘河故道斜趨入薊運河，開新河萬四千一百餘丈，俾通省河流分溜由北塘歸海。石莊戶決口，奪溜南趨，命寶楨速籌堵築。旋以決口驟難施工，請在迤下之賈莊建壩堵合，即於南北岸普築長堤。而北岸濮州之上遊為開州，並飭直督合力籌辦。
光緒元年，濬文安勝芳河，修菏澤賈莊南岸長堤及北岸金堤。二年，濬張家橋新舊泗河。三年，濬濟寧夏鎮迤南十字河。給事中夏獻馨請修水利以裕民食，諭各督撫酌奪情形，悉心區畫。四年，修補濱江黃柏山至樊口四十里老堤，並於樊口內建石閘。五年，修都江堰堤，灌縣、溫江、崇慶舊淹田地涸復八萬二千餘畝。

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七年，挑濬大清河下遊，使水暢入東澱，並於獻縣硃家口古羊河東岸另闢滹沱減河，使水歸子牙河故道，達津入海。濬寶坻、武清境內北運減河。大學士左宗棠請興辦順直水利，以陝甘應餉之軍助直隷治河之役。總督李鴻章言：「近畿水利，受病過深，凡永定、大清、滹沱、北運、南運五大河，及附麗之六十餘支河，原有閘壩堤墊，無一不壞，減河引河，無一不塞，而節宣諸水之南泊、北泊、東澱、西澱，早被濁流填淤，僅恃天津三岔口一綫海河，迤邐出口。平時既不能暢消，秋冬海潮頂托倒灌，節節皆病。修治之法，須先從此入手。五大河中，以永定之害為最深。其大清、北運、南運，須分別挑濬築堤，修復減河。滹沱趨向無定，自來未設堤防。同治七年，由槁城北徙，以文安大窪為壑，其故道之難復，上遊之難分，下遊之難泄，曾國籓與臣詳陳有案。東西澱寬廣數百里，淤泥厚積，人力難施。頻年以來，修復永定河金門閘壩，裁灣切灘，加築是段。大清河則於新、雄境內開盧僧減河，霸州、文安境內接開中亭、勝芳等河，分泄上遊盛漲；於任丘開趙王減河，分泄西澱盛漲；又於文安左各莊至台頭挑河身二十餘裡，以暢下遊去路。滹沱河則於河間及文安挖開引河二，又於獻縣硃家口另闢減河三十餘裡，均歸子牙河達津。北運河則於通州築壩，輓潮白河歸槽，於香河王家務、武清筐兒港修復石壩，以泄漲水，於天津霍家嘴疏濬引河，以通下口。又於武清、寶坻挑挖王家務、筐兒港兩減河，以資暢泄。南運河則於青、滄、靜海修堤二百餘裡，於靜海新官屯另闢減河六十餘裡，使別途出海。又於天津城東永定、大清、滹沱、北運交會之陳家灣，開河百餘裡，分泄四大河之水，逕達北塘入海。其無極、蠡、博、高陽一帶，則堅築珠龍河是，以防滹沱北越。任丘至天津一帶，則加築千里堤、格澱堤，使河自河而澱自澱。又於廣平開洺河，順德挑澧河，趙州濬、槐、午諸河。此外河道受害較深者，均酌量疏築。今宗棠請以隨帶各營移治上遊，正可輔直隷之不逮。此後應修何處，當隨時會商，實力襄助。」疏入，命恭親王奕、醇親王奕枻會同辦理。是年加修子牙河堤萬七千四百餘丈，文安西堤二千九百餘丈，展寬靜海東堤二千四百餘丈。
九年，安徽學政徐郙言：「江、皖兩省水患頻仍，亟須挑泗、沂為導淮先路，仿抽溝法，循序疏治，由大通口引河入海，泄水較易。」命宗棠、昌濬會商籌辦。尋疏覆言：「天下無有利無害之水，疏舊黃河，分減泗、沂，近年已著成效，自當加挑寬深，兼疏大通口以暢出海之途，設復淮局於清江，派員提調。估計分年分段興辦，去其太甚之害，留其本然之利。江北於皖省為下遊，下遊利，上遊自無不利矣。」報聞。
十年，河南巡撫鹿傳霖言：「豫省地勢平衍，衛、淇、沁、潭襟帶西北，淮、汝、渦、潁交匯東南，如果一律疏通，加以溝渠引灌，農田大可受益。今河道半皆壅滯，溝渠亦多荒廢，擬借人力以補天災，派員分赴各州縣履勘籌畫，或疏或濬，志在必成，使民間曉然於有利農田，自能踴躍用命。」詔如所請行。宗棠言：「興修江南水利各工，最大者為硃家山、赤山湖。硃家山自浦口至張家堡，接通滁河，綿亙百二十餘裡。赤山湖自道士壩、蟹子壩至三汊河下遊，亦綿亙百二十里。兩年工竣，不惟沿江圩田均受其利，而糧艘貨船亦可由內河行，尤屬農商兩便。」下部知之。十一年七月，以張曜所部十營、馮南斌二營、蔣東才四營，濬京師內外護城河，十一月竣工。十三年，河決鄭州，全溜注淮，因濬張福口引河，及興化之大周閘河、丁溪場之古河口、小海三河，俾由新陽、射陽等河入海。十四年，鑿廣西江面險灘，由蒼梧迄陽朔七百餘裡，共開險灘三十五。
十六年，江蘇巡撫剛毅以寶山藴藻河道失修，迤西大壩壅遏水脈，請興工挑築。給事中金壽松言利少害多，命總督曾國荃妥籌。覆疏言，擬拆去同治間所築土壩，以通嘉定、寶山之水道，仍規復鹹豐間所建舊閘，以還嘉定之水利。另開引河以通河流，俾得隨時宣洩。下部知之。挑濬餘杭南湖，並疏濬苕溪。華州羅紋河下遊各村連年遭水，沿河數百頃良田盡成澤國。巡撫鹿傳霖請由吳家橋北大荔之胡村，開渠引水注渭，則其流舒暢，被淹民田，即可涸復耕作，從之。

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